La PTH Benediktbeuern è equiparata alle facoltà di teologia presso università statali. Ciò significa che lo studio di teologia cattolica può essere assolto con la laurea, la licenza, il dottorato e l’abilitazione.

Una delle caratteristiche di Benediktbeuern è la presenza di una cattedra propria di pastorale giovanile. Sulla base di una cooperazione esistente tra l’università di filosofia e teologia e l’Accademia cattolica professionale di scienze sociali (KSFH) è possibile a Benediktbeuern un »doppio studio« in teologia cattolica e scienze sociali.

La congregazione dei Salesiani di Don Bosco, organo reggente dell’Università di filosofia e teologia, pone una particolare attenzione ad un collegamento intenso tra teoria e prassi. Per questo l’Università collabora in stretto contatto con gli altri istituti di formazione giovanile presenti nel monastero (l'Istituto per la spiritualità salesiana, l'Istituto di pastorale giovanile Don Bosco, il Centro di formazione giovanile Aktionszentrum, il Centro per l’ambiente e la cultura).

Ex studenti dell’Università di filosofia e teologia sono presenti nel mondo del lavoro in prevalenza in campo pastorale. Essi lavorano nelle parrocchie, presso associazioni giovanili, in centri per giovani, in centri di formazione. Sono inoltre attivi come referenti pastorali, come insegnanti di religione, come street worker, come ricercatori e come preti. Negli ultimi anni si sono aperte per i laureati di Benediktbeuern nuove prospettive di impiego: giornalismo e scienze editoriali, lavoro nel campo delle risorse umane presso aziende private, ditte operanti nel campo dell’informatica e dei viaggi, attività in campo ambientale, culturale e politico.

Dal semestre invernale 2007/08 l’Università di filosofia e teologia esige contributi per lo studio (Studienbeiträge).

Dal semestre invernale 2010/11 i corsi di teologia cattolica saranno modularizzati (Modularisierung: PTH blickt in die Zukunft).